Ιδιαίτερη μέρα ήταν για τον Γιάννη Αλαφούζο η Τρίτη 2/7, καθώς γιόρτασε τα 67α γενέθλιά του.
Τον Σεπτέμβριο του 2012 ανέλαβε πρόεδρος της ΠΑΕ Παναθηναϊκός, προκειμένου να προχωρήσει στην αναδιοργάνωση και εξυγίανση του συλλόγου.
Κατά την προεδρία του ο Παναθηναϊκός έχει κατακτήσει τρείς φορές το Κύπελλο Ελλάδας (2014, 2022 και 2024).